根据放入饲育床内种蚓的数量、种类以及时期，待蚯蚓充分繁殖产茧后，饲育床内的饲料被蚯蚓食取。转化成蚓粪的时期虽有所不同，但大致在4~8个月时间内完成，接着就需要分别将蚓粪、种蚓和幼蚓分离出来。其具体操作方法如下(图32)：首先取掉覆盖物c，然后在 A’饲育床上铺设 16~32毫米左右网眼的 M网③，在其上面加上防御用金属网④，再加上5~10毫米网眼的 N网⑤。这里所以加上防御用金属网，是为了使M和N网之间间隔1厘米，保持仅使蚯蚓进入的空间。为了此目的，也可采用其他方法。接着取A饲育床中表面下5厘米的敷设物，为了不要大的块状物，应将敷设物仔细加以粉碎，把它铺满在A’饲育床上。即 N网上约5厘米的高度⑥。这上面如有日光照射，由于蚯蚓有怕光和怕热的习性，蚯蚓就朝下方移动。或许因日照不足或仅日照，蚯蚓不太移动时，则可用敷设在⑥上面的电热加热装置⑦(图33)加热，强迫蚯蚓向下方移动。这样，⑥内的蚯蚓通过 N网，到达 M网，幼蚓被阻止在 M 网上，就可以捕获住蚯蚓。进一步粉碎饲育床敷设物⑥，取出进入块状物中的蚯蚓，N网⑤上就残留着没有蚯蚓的蚓粪了，然后把蚓粪集中起来运出。用时也可同时取出M 网③上的种成蚓产品。如无需分离取出种、成蚓时，就不用M网③及防御用金属网④，仅使用N网⑤就足够了。
反复进行上述操作，处理完 A 饲育床。这样，增殖用的蚯蚓都从A 饲育床移向了A’饲育床。当确认A饲育床繁殖完成后，用以上同样的方法，在新的A饲育床上进行蚓粪、种蚓和幼蚓的分离处理。这种方法能够大大节省劳力和经费。但这种方法也常受气候、天气等影响。因此也常用其他方法处理。
(3)机械分离采收方法 据报道，美国于 1979年发明了一种蚯蚓收采的机具，其构造如下(图34)：
当把已充分繁殖好的蚯蚓、蚓茧和剩余饲料、蚓粪等混合物装入喂料斗后，开动马达，饲料会因振动而破碎，从4号筛漏人1号筛中，其中蚓粪和部分蚓茧落人5号箱回收，其他剩余到达2号筛时。因拍打，饲料块进一步破碎，下滑到3号筛，大约有50%的小蚯蚓和50% ~70%的蚓茧、细土落人6号箱回收。剩余物再下降到9号输送器；其中大蚯蚓爬附于输送器上，并经水
图34蚯蚓收获机具的前侧面图(自美国 4147256号专刊)
1~4.孔眼(方孔) 大小不同的方筛: 1号筛孔长0.158 75 厘米,2号筛孔长0.9525厘米, 3号筛孔长0.635厘米,4号筛孔长0.9525厘米
5、6.料箱7.固定支架8.电动机
9.输送 器振动装置， 并带动筛下许多拍打装置 10.收集箱
平方向输送到10号箱回收。其他大而硬、未被破碎的残余物向下落人到最下面的箱内。这样就可大致将蚯蚓、蚓粪、蚓茧和小蚯蚓分离出来。
除上述几种方法外，还有翻箱采收法、高温驱逐采收法、锤击驱逐采收法、筐诱采收法、弱光出穴采收法等等。上述各种方法均是根据蚯蚓的生活习性，或某一习性特点被人们所利用的。