1.器官组织压片检查 采取肝、脾、心包、心肌、气囊和肾等组织制成压片，用姬姆萨染色后镜检，衣原体呈紫色；用Gimecez 氏染色液染色后，衣原体原生小体呈红色，网状体呈蓝色。检查到包涵体即可确诊。
2.分离培养 采取肝、脾、肾、心肌、气管、粪便等新鲜病料，用灭菌生理盐水制成1，10~20匀浆悬液，加入500毫克/毫升链霉素或50毫克/毫升庆大霉素或500毫克/毫升万古霉素，感作后低速离心，取上清液进行分离培养。培养方法可采用鸡胚接种、小
鼠接种及细胞培养等方法。
3.血清学试验 目前我国用于禽衣原体病诊断的血清学方法主要是补体结合试验和间接血凝试验。
(1)微量间接血凝试验 鸽等被检血清应做560C30分钟灭能，鸡的被检血清应做56℃35分钟灭能。当被检血清效价在1：16(++)以上时可判为阳性；当效价在1：4(十十)以下时判为阴性；介于两者之间视为可疑，经重检后仍为可疑则判为阳性。
(2)补体结合试验 直接补体结合试验多用于鹦鹉及非老龄鸽的血清抗体检测，间接补体结合试验则适用于其他禽类。鸽等禽类被检血清应做56℃30分钟灭能处理，鸡等被检血清则做56℃35分钟灭能处理。通常按补体结合反应常规程序进行，鸽、鹦鹉、鹤鹑、鸡血清判定标准为：被检血清效价在1：8(++，50%溶血)以上判为阳性；被检血清效价小于1：4(十，75%溶血)判为阴性；被检血清效价等于1：8(十)或1：4(+十)时判为可疑，应做重检，2次可疑判为阳性。本法选用于试管法和微量板法。
【鉴别诊断】 首先应与有眼部炎症的鸽痘病、亚利桑那菌病、大肠杆菌性全眼球炎、曲霉菌性眼炎、维生素A缺乏症、眼线虫病、嗜眼吸虫病进行鉴别。其中后两种病在用生理盐水冲洗眼睛时，可将虫体冲洗出来，以此作鉴别。其余各病在前面均已述及。
其次是与有纤维素性心包炎、肝周炎、气囊炎的大肠杆菌病和链球菌病相区别。
【预防与治疗】 四环素类抗生素尤其是金霉素对本病有较好的疗效。金霉素的用量：以饲料中含量0.5%或饮水中浓度0.25%，连续4天投药。对个别严重的病例，可按每千克体重100~120毫克逐只喂服。预防量可减半。强力霉素也有很好的疗效，胸肌注射75~100毫克/千克体重的剂量，在5~6天内血液中的浓度可保持在1毫克/毫升以上，所以在45天的时间内注射8~10次即可发挥作用；口服剂量为8~25毫克/千克体重，每天2次，连续投服3045天。严重病例可按10~100毫克/千克体重剂量静脉注射1~2次，然后再转入口服剂量。
本病的预防主要是杜绝传染来源，不引进血清学检验阳性的鸽子。此外，还应定期检查及预防性用药。栏舍内宜保持适当的湿度，避免病原随尘埃传播。定期检查包括血细胞凝集试验、琼脂扩散试验进行抗体检测，取样进行鸡胚接种做抗原(病原)检查。